Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms