Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms