Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms