Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Ccdc18Q640L5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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Ccdc18Q640L5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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Ccdc18Q640L5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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