Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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