Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms