Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms