Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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