Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms