Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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