Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms