Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hbq1bQ3U0A6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hbq1bQ3U0A6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms