Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms