Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rpusd2Q149F1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rpusd2Q149F1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rpusd2Q149F1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rpusd2Q149F1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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