Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms