Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms