Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms