Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms