Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms