Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms