Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms