Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms