Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms