Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms