Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf3P70671 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf3P70671 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf3P70671 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms