Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ufm1P61961 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ufm1P61961 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ufm1P61961 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ufm1P61961 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ufm1P61961 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ufm1P61961 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ufm1P61961 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ufm1P61961 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ufm1P61961 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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