Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms