Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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