Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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