Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms