Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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