Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc3P33622 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms