Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SsbP32067 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SsbP32067 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SsbP32067 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SsbP32067 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SsbP32067 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SsbP32067 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SsbP32067 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SsbP32067 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SsbP32067 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SsbP32067 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SsbP32067 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SsbP32067 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms