Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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