Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Xrcc5P27641 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Xrcc5P27641 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Xrcc5P27641 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Xrcc5P27641 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Xrcc5P27641 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Xrcc5P27641 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc5P27641 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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