Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NdnP25233 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NdnP25233 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NdnP25233 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms