Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3P21107 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3P21107 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms