Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms