Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P18530 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P18530 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18530 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18530 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18530 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18530 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18530 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms