Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms