Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FosbP13346 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FosbP13346 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FosbP13346 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FosbP13346 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FosbP13346 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FosbP13346 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FosbP13346 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FosbP13346 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FosbP13346 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FosbP13346 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FosbP13346 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FosbP13346 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FosbP13346 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FosbP13346 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms