Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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TtrP07309 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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TtrP07309 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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TtrP07309 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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TtrP07309 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TtrP07309 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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