Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tgfb1P04202 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tgfb1P04202 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tgfb1P04202 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tgfb1P04202 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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