Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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