Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptpn20O55082 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptpn20O55082 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptpn20O55082 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptpn20O55082 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptpn20O55082 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms