Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab33bO35963 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab33bO35963 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab33bO35963 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab33bO35963 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab33bO35963 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab33bO35963 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab33bO35963 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab33bO35963 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms