Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms