Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms