Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Edil3O35474 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Edil3O35474 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms