Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh2d1bO35324 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh2d1bO35324 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh2d1bO35324 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh2d1bO35324 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh2d1bO35324 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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